基于流行病学研究设计的R语言实践

《基于流行病学研究设计的R语言实践》一书分 为十四章，以流行病学研究设计为主线展开，在R语 言基本介绍的基础上，详细描述了横断面研究、病 例对照研究、病例交叉研究、队列研究、随机对照 试验研究、时间序列分析、Meta分析、倍差法、孟 德尔随机化研究等常用的流行病学研究设计，同时 描述了其中涉及的统计方法R语言代码实现过程，并 介绍了R语言作图和空间制图，可为预防医学相关专 业本科生、研究生学习以及流行病学、社会学等相 关领域科研人员利用R语言研究医学问题提供参考。

第一章 R语言概述 一、R软件及RStudio软件的获取和安装 二、RStudio软件界面和功能介绍 三、R语言的使用规则简介 第二章 数据结构与数据管理 第一节 常见的数据类型 第二节 数据的基本结构 一、向量 二、矩阵 三、数组 四、数据框 五、因子 六、列表 第三节 数据的导入与保存 一、数据导入 二、数据保存 第四节 数据的初步操作 一、数据的整合、重塑与合并 二、定义数据分组 三、从数据中抽取子集 第五节 数据的管理和基础应用 一、获取数据集中变量的名称 二、创建新的变量 三、变量的重命名 四、缺失值的发现与处理 五、数据排序 六、数据类型的转换 七、数据描述 第六节 大数据分析 一、创建data/table 二、设置主键 三、查看数据 四、提取数据集 五、数据整理 第七节 R语言自带的数据集 第三章 基本统计分析 第一节 t检验 一、单样本t检验 二、配对t检验 三、两独立样本均数比较的t检验 四、小结 第二节 方差分析 一、完全随机设计的方差分析 二、随机区组设计的方差分析 三、小结 第三节 χ2检验 一、2×2交叉表数据的χ2检验 二、R×C交叉表数据的χ2检验 三、配对设计数据的χ2检验 四、χ2检验的校正 五、小结 第四节 秩和检验 一、配对设计资料的符号秩和检验 二、两组独立样本比较的Mann-Whitney检验 三、多组独立样本比较的Kurskal-Wallis检验 四、小结 第五节 相关分析 一、简单相关分析 二、偏相关 三、相关关系的可视化 四、小结 第六节 回归分析 一、简单线性回归 二、多项式回归 三、多重线性回归 四、Logistic回归 五、泊松回归 六、小结 第四章 横断面研究 第一节 横断面研究资料的描述 一、案例分析 二、小结 第二节 多重线性回归 一、多重线性回归分析 二、小结 第三节 二分类变量的Logistic回归 一、二分类Logistic回归分析 二、小结 第四节 无序多分类变量的Logistic回归 一、无序多分类Logistic回归分析 二、小结 第五节 有序多分类变量的Logistic回归 一、有序多分类变量的Logistic回归分析 二、小结 第六节 交互作用分析 一、多重线性回归模型中的交互作用分析 二、广义线性回归模型中的交互作用分析 三、小结 第五章 病例对照研究 第一节 概述 一、基本概念 二、基本特点 三、研究类型 四、病例对照研究的衍生设计 五、用途 第二节 资料分析方法与案例分析 一、资料分析方法 二、案例分析 第六章 病例交叉设计 第一节 概述 第二节 时间分层病例交叉设计 一、案例分析 二、小结 第三节 时间分层病例交叉设计结合分布滞后非线性模型 一、案例分析 二、小结 第四节 基于个体的时间分层病例交叉设计 一、案例分析 二、小结 第七章 队列研究 第一节 队列研究中的生存分析 一、基本概念 二、生存数据案例 三、使用R软件进行生存分析 第二节 中介效应分析 一、中介效应分析的基本原理和步骤 二、中介效应分析在R语言中的实现 第八章 随机对照试验研究 第一节 概述 一、定义和基本原理 二、试验设计关键点和常见设计方案 第二节 资料整理与分析 一、资料的整理 二、资料的分析 三、结果输出 第三节 案例分析 一、数据描述与预处理 二、预分析与生存曲线 三、Cox比例风险回归 四、亚组分析及比较 第九章 时间序列分析 第一节 时间序列的基本概念和特点 一、案例分析 二、小结 第二节 缺失数据的填补 一、案例分析 二、小结 第三节 广义相加模型及其应用 一、案例分析 二、小结 第四节 分布滞后非线性模型及应用 一、案例分析 二、小结 第十章 Meta分析 第一节 单因素Meta分析 一、单因素Meta分析概述 二、案例分析 三、小结 第二节 多因素Meta分析 一、多因素Meta分析概述 二、案例分析 三、小结 第三节 Meta回归分析 一、Meta回归分析概述 二、案例分析 三、小结 第十一章 R语言作图 第一节 plot基本作图 一、展开空白画布 二、描绘平面直角坐标系 三、绘制点图 四、绘制线图 五、改变图形元素 六、添加文本信息 七、页面布局与图形组合 第二节 ggplot2基本作图 一、散点图 二、直方图 三、箱线图 第三节 ggplot2进阶 一、坐标轴 二、图例