棉花基因组学

本书内容包含：棉花基因组调研与组装、棉花二倍体基因组研究、异源四倍体棉花基因组研究、棉花种质资源与变异组学研究、植物三维基因组学研究和棉花的表观遗传学研究。第一章介绍了基因组调研、测序技术、序列组装和基因注释相关的基础理论知识：第二章和第三章分别介绍了棉花二倍体和异源四倍体基因组研究的具体案例与科学发现：第四章主要概述了中国棉花种质资源的创新与利用现状，介绍了亚洲棉、陆地棉和海岛棉的变异组学研究进展，总结了重要农艺性状形成的关键位点和基因：第五章介绍了植物三维基因组学发展历程、主要技术、数据分析流程和近期新研究进展：最后一章介绍表观遗传基因组研究现状，总结了DNA甲基化、蛋白质翻译后修饰和非编码RNA研究成果以及棉花表观遗传研究进展。
本书适于生物信总学、基因组学、作物遗传学、三维基因组学、表观遗传学等相关领域科研院所和高校的教师、研究生、科研人员，以及生物技术企业的科研人员参考阅读。

前言
第一章棉花基因组调研与组装1
第一节基因组调研1
第二节基因组测序与组装7
第三节基因组可视化与注释22
第四节棉花基因组组装案例29
参考文献31
第二章棉花二倍体基因组研究34
第一节棉花二倍体基因组概述34
第二节棉花二倍体基因组大事记35
第三节雷蒙德氏棉基因组研究进展41
第四节亚洲棉基因组研究进展46
第五节澳洲棉基因组研究进展52
第六节瑟伯氏棉和戴维逊氏棉基因组研究进展56
第七节特纳氏棉基因组研究进展66
第八节草棉基因组研究进展67
第九节长萼棉基因组研究进展69
第十节异常棉基因组研究进展70
第十一节司笃克氏棉基因组研究进展73
第十二节比克氏棉基因组研究进展74
第十三节圆叶棉、亚洲棉、雷蒙德氏棉基因组研究进展82
参考文献90
第三章异源四倍体棉花基因组研究92
第一节异源四倍体棉花基因组研究现状92
第二节陆地棉基因组测序研究进展99
第三节海岛棉基因组研究进展134
第四节其他四倍体棉花基因组研究进展138
参考文献146
第四章棉花种质资源与变异组学研究149
第一节中国棉花种质资源概况149
第二节全转录组关联分析157
第三节亚洲棉变异组及重要性状遗传基础解析160
第四节陆地棉变异组及重要性状遗传基础解析168
第五节海岛棉变异组研究195
参考文献204
第五章植物三维基因组学研究207
第一节三维基因组学概述207
第二节三维基因组学研究技术209
第三节植物三维基因组层级结构219
第四节三维基因组数据分析228
第五节三维基因组可视化236
第六节植物三维基因组研究进展238
第七节展望240
参考文献240
第六章棉花的表观遗传学研究251
第一节表观遗传学的发展、定义和分类251
第二节表观遗传学的研究现状252
第三节棉花基因组DNA甲基化研究进展256
第四节棉花蛋白质翻译后修饰研究进展266
第五节棉花非编码RNA研究进展276
第六节棉花表观修饰和多倍体基因组进化282
第七节表观修饰之间的互作及其意义290
第八节棉花表观遗传研究展望293
参考文献296