医学知识组织

《医学知识组织》教材的编写内容是面向高等院校医学信息学本科生及相关专业研究生，针对现阶段医学信息特点与知识服务需求，系统介绍了医学知识组织方法、技术及其在医学各类信息、各领域中的应用。内容包括：医学组织发展与相关理论基础，医学知识组织方法与过程，医学术语、编码体系等知识组织系统，医学知识处理与表示，医学文献、数据及网络信息的组织与利用，基础、临床、药学、公共卫生、中医药等医学核心领域知识组织，以及医学知识图谱。

第一章绪论1
第一节医学知识组织基本概念1
一、知识组织概念起源1
二、医学知识组织内涵3
三、医学知识组织的意义与作用3
第二节医学知识组织内容4
一、医学知识组织对象4
二、医学知识组织内容范围5
三、医学知识组织层次6
第三节医学知识组织发展7
一、医学知识组织发展阶段7
二、医学知识组织发展特点8
三、国际学协会、学术期刊与交流平台9
第二章医学知识组织理论与方法12
第一节医学知识组织基本理论12
一、医学知识组织的学科基础理论12
二、有序化理论15
三、医学知识组织的其他相关理论16
第二节医学知识组织基本方法17
一、知识组织方法概述17
二、知识组织的语法学方法18
三、知识组织的语义学方法20
四、知识组织的语用学方法27
第三节医学知识组织的原则与构成要素30
一、医学知识组织原则30
二、医学知识组织构成要素32
第四节医学知识组织过程33
一、医学知识组织总体流程33
二、医学知识资源提取34
三、医学知识规范化35
四、医学知识存储37
五、医学知识推理及更新38
六、医学知识服务39
第三章医学知识组织系统：术语与编码41
第一节医学知识组织系统概述41
一、医学知识组织系统概念41
二、医学知识组织系统类型41
三、医学知识组织系统功能43
四、医学知识组织系统发展44
第二节医学知识组织系统内容结构45
一、医学知识组织系统宏观结构45
二、医学知识组织系统微观结构47
第三节医学知识组织系统构建与互操作51
一、医学知识组织系统构建方法51
二、医学知识组织系统构建工具52
三、医学知识组织系统构建案例55
四、医学知识组织系统互操作57
第四节医学知识组织系统服务与应用59
一、医学知识组织系统服务59
二、医学知识组织系统应用60
第四章医学知识处理与表示63
第一节医学知识抽取63
一、医学实体抽取63
二、医学关系抽取69
第二节医学知识表示77
一、逻辑表示法77
二、产生式规则表示法79
三、语义网表示法81
四、框架表示法84
第三节医学知识融合86
一、数据层知识融合87
二、概念层知识融合89
三、跨语言知识融合91
第五章医学知识图谱94
第一节知识图谱概述94
一、知识图谱及相关概念94
二、知识图谱发展脉络96
三、医学知识图谱及其主要应用场景96
第二节知识图谱的构建97
一、知识图谱的逻辑结构97
二、知识图谱的构建方式98
三、知识图谱构建的主要流程98
四、知识图谱质量评估98
五、知识图谱的存储99
第三节医学知识图谱系统案例99
一、中文医学知识图谱99
二、基于指南的非小细胞肺癌知识图谱100
三、罕见病知识图谱诊断模型103
四、医学百科知识图谱106
第六章医学文献组织108
第一节医学文献组织概述108
一、医学文献组织的内容108
二、医学文献组织的发展趋势109
第二节医学文献描述109
一、文献描述的元数据方案109
二、机读目录110
三、都柏林核心元数据113
第三节医学文献分类标引114
一、中国图书馆分类法115
二、中国图书馆分类法·医学专业分类表116
三、分类标引的方法与原则118
第四节医学文献主题标引119
一、医学主题词表119
二、一体化语言系统122
三、主题标引的方法与原则123
第五节医学文献组织应用案例124
一、PubMed124
二、中国生物医学文献服务系统126
第七章医学数据组织128
第一节医学数据及其组织概述128
一、医学数据的产生128
二、医学数据的特点和类型129
三、医学数据组织的目的和要求131
第二节医学数据组织过程132
一、数据收集132
二、数据预处理133
三、加工整理135
四、数据存储139
第三节医学数据组织技术140
一、数据仓库140
二、语义网142
三、机器学习与深度学习144
四、医学数据可视化145
第四节医学数据组织案例146
一、重症监护医学数据库146
二、生物医学领域语义数据集成平台148
三、人口健康数据仓储149
第八章网络医学信息组织152
第一节网络医学信息概述152
一、网络医学信息的类型及特点152
二、网络医学信息描述153
三、网络医学信息的存储方式154
四、网络医学信息的传输与交换154
第二节网络医学信息组织方式155
一、网络医学信息组织概述155
二、网络知识组织系统156
三、搜索引擎156
第三节网络医学信息组织技术160
一、索引技术160
二、网页排序算法160
三、推荐算法161
四、网络医学知识映射和聚合162
第四节网络医学信息组织应用案例163
一、健康在线基金会医学网站163
二、智能问答系统164
第九章基础医学知识组织167
第一节基础医学领域资源及特征167
一、生物信息资源167
二、解剖与病理数据资源169
三、生理与生化数据资源170
四、医学微生物数据资源171
第二节典型基础医学知识组织系统171
一、美国国家生物技术信息中心分类法172
二、基因本体172
三、人类基因组织基因命名表173
四、人类表型本体173
五、解剖学基础模型本体174
第三节基础医学领域知识组织应用175
一、GenBank数据库175
二、组学原始数据归档库176
三、UniProt数据库178
第十章临床医学知识组织181
第一节临床医学信息资源及特征181
一、临床医学信息资源概述181
二、典型临床医学信息资源182
第二节信息标准与典型临床医学知识组织系统185
一、电子病历基本数据集与共享文档规范186
二、医疗信息交换与互操作标准187
三、医学数字成像和通信189
四、国际疾病分类表190
五、观测指标标识符逻辑命名与编码系统191
六、系统化临床医学术语集192
第三节临床知识组织应用实践193
一、临床知识服务系统总体框架193
二、临床数据治理194
三、临床案例知识库197
四、临床决策支持系统200
第十一章药学知识组织203
第一节药学信息资源及特征203
一、药物研发与监管信息203
二、药物生产与流通信息204
三、临床用药与智能用药信息205
第二节典型药学知识组织系统207
一、中国药典207
二、词典209
三、术语表212
第三节药学领域知识组织应用215
一、药物数据库DrugBank216
二、美国食品药品监督管理局不良事件报告系统217
第十二章公共卫生领域知识组织219
第一节公共卫生信息资源及特征219
一、公共卫生信息资源概述219
二、主要的公共卫生业务信息资源220
第二节典型的公共卫生知识组织系统223
一、中国公共卫生信息分类与编码体系223
二、电子健康档案基本数据集标准226
三、人口健康科学数据共享数据集分类与编码标准228
四、MedlinePlus健康主题词表230
第三节公共卫生领域知识组织应用231
一、中国疾病预防控制中心数据资源平台231
二、中国公共卫生科学数据中心数据资源平台233
三、美国国家环境卫生中心数据资源系统235
第十三章中医药领域知识组织238
第一节中医药信息资源及特征238
一、中医领域238
二、中药领域239
三、针灸领域240
四、中医古籍241
第二节中医药信息标准242
一、中医药数据标准242
二、中医药术语系统分类标准244
三、中药编码系统系列标准247
四、针灸语义范畴结构标准248
五、中医古籍相关标准249
第三节典型的中医药知识组织系统250
一、中医药学语言系统250
二、中医临床术语系统251
三、中医药学主题词表253
四、中医古籍后控词表254
第四节中医药领域知识组织应用254
一、中国中医药期刊文献数据库255
二、国医典藏古籍文献资源库256
三、中医药语义百科系统258
四、中医药智能问答系统260
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中英文名词对照索引265