噬菌体药理学及其实验方法

在细菌抗药性日愈严重的当下，噬菌体治疗是对抗细菌感染更有前景的治疗方法。在我国这样一个人口众多的农业大国，细菌抗药性的问题尤其尖锐，细菌抗药性使得一个个曾经有效的抗生素失效，对人类的健康生存提出了巨大的挑战。噬菌体治疗从原理上与抗生素不同，克服了细菌抗药性，对其进行深入的研究与应用，将使人们掌握更有效的对抗细菌方法，因而意义深远。

噬菌体是细菌特异性病毒，也是潜在的活体抗菌药物，必将在防治细菌感染和污染中发挥重要作用，亟待开展药理学研究和规范。 本书以噬菌体药理学为主线，串联噬菌体分离、生物学性质、噬菌体-宿主相互作用、噬菌体评价方法、生物信息学、噬菌体应用的技术方法。本书将对提高动物保护、植物保护、畜牧业、农业和食品行业人员的噬菌体研发和应用能力，实施减抗降抗，控制超级细菌等发挥积极作用。

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绪论：噬菌体群体治疗药理学方法和框架
第1部分基础噬菌体学
1水和土壤中噬菌体的富集
2环境样品中噬菌体的分离方法
3溶原诱导法分离噬菌体
4氯化铁絮凝回收海水中的噬菌体
5阴离子交换色谱法纯化噬菌体
6噬菌体计数——双层平板法
7噬菌体计数——直接涂板法
8噬菌体的计数——微量滴定板法
9噬菌体的电镜观察
10噬菌体宿主范围和裂解率的测定
11噬菌体对细胞吸附率的测定
12一步生长曲线测定
13利用纯化受体测定噬菌体的失活动力学
14噬菌体突变株的构建
15裂解性噬菌体的普遍性转导
16噬菌体的高通量筛选
17家蚕幼虫模型在噬菌体治疗实验中的应用
18大蜡螟幼虫替代动物作为感染模型分析病原菌致病力的应用
19果蝇感染模型和评价噬菌体抗菌效果的应用
20浮萍和紫苜蓿作为细菌感染模型系统的应用
21鸡胚致死试验评估噬菌体治疗效果的应用
22噬菌体-生物膜相互作用的评价技术
23使用噬菌体FISH法检测单细胞水平的噬菌体感染
24酶谱分析噬菌体裂解蛋白的肽聚糖水解活性
25即食食品中噬菌体效果的定量测定
第2部分噬菌体生物信息学
26噬菌体的分类与命名
27病毒组研究方法
28常见细菌的噬菌体
29噬菌体研究的网络资源
30噬菌体表征的必要步骤：生物学、分类学和基因组分析
31使用RAST对噬菌体基因组注释
32噬菌体基因组数据的可视化分析：比较基因组学和作图
33噬菌体裂解物的制备和DNA纯化
34脉冲场凝胶电泳（PFGE）测定噬菌体基因组大小
35噬菌体基因组末端的高通量测序分析
36通过分析有尾噬菌体基因组的末端确定DNA包装策略
37来自单一噬菌斑的双链DNA噬菌体的基因组测序
38利用感染裂解性噬菌体的细胞构建cDNA文库以使用RNA-Seq进行转录组分析
39荧光定量PCR测定宿主菌和噬菌体mRNA的表达
40噬菌体的纯化以及噬菌体结构蛋白的SDS-PAGE分析
41噬菌体蛋白质组学：质谱的应用
第3部分噬菌体应用
42噬菌体治疗
43使用Strep-tagRⅡ纯化分析噬菌体-宿主的蛋白质-蛋白质相互作用
44用于分枝杆菌药物敏感性试验的荧光杆菌噬菌体
45工程噬菌体生物传感器
46将噬菌体基因组导入大肠埃希菌的电穿孔法
47枯草芽孢杆菌噬菌体SPO1的定点突变
48电穿孔DNA噬菌体重组技术（BRED）在裂解性噬菌体基因操作中的应用
49用亲和层析法分离竞争性噬菌体修饰展示的T4噬菌体
50用于检测和生物防控的噬菌体及其蛋白质的固定化
51铜绿假单胞菌噬菌体中编码生长抑制性ORFan的筛选
52噬菌体展示技术