发酵垫料整合微生物组菌剂研发与应用

1.内容全面详细，实验图表展示完整，彩色印刷，清晰展示了各种水平的微生物含量结构、种群热图、菌群分析分型细菌生长照片等。 2.作者团队是微生物发酵床的发明人之一，本书收录了团队的优选和丰富的研究成果，对专业读者具有较好的参考价值和启发性。 3.本书为国家出版基金资助重点书。

本书是“畜禽粪污微生物治理及其资源化利用丛书”的一个分册，全书共六章，主要介绍了整合微生物菌组剂的提出、研发与应用，菌剂发酵床特征微生物空间分布，整合微生物组菌剂微生物组多样性，整合微生物组菌剂的作用机理，整合微生物组菌剂功能群与同工菌和整合微生物组菌剂的应用。本书具有较强的技术应用性和针对性，可供从事畜禽养殖、环境保护、生物农药、生物肥料、微生物菌剂和微生物研究科研人员、技术人员和管理人员参考，也可供高等学校环境科学与工程、生物工程、农业工程及相关专业师生参阅。

刘波，福建省农业科学院农业生物资源研究所，二级研究员，德国博士后，美国访问学者；从事微生物生物技术与农业污染微生物治理研究，国家发改委微生物菌剂国地工程研究中心主任，微生物发酵床发明人之一，研究获专利40项，发表论文600多篇（SCI=80多篇），出版作者19部，获得各级科技奖项19个。

第一章 整合微生物菌组剂的提出、研发与应用001
第一节 连作障碍与根际微生物组002
一、连作障碍引起作物产量下降002
二、作物根际微生物组变化003
三、作物根际微生物组的重建004
四、整合微生物组菌剂概念的提出004
五、整合微生物组菌剂的研究005
第二节 整合微生物组菌剂的研究方法008
一、整合微生物组菌剂的生产过程008
二、整合微生物组菌剂营养成分分析008
三、整合微生物组菌剂芽胞杆菌活菌总含量的测定009
四、基于宏基因组的整合菌剂产品细菌微生物组的测定009
五、整合微生物组菌剂对种子发芽影响的测定009
六、整合微生物组菌剂对番茄穴盘育苗壮苗作用的研究方法010
七、整合微生物组菌剂对番茄穴盘育苗青枯病防控的研究方法010
第三节 整合微生物组菌剂产品特性010
一、整合微生物组菌剂生产工艺简述010
二、整合微生物组菌剂营养成分分析012
三、整合微生物组菌剂芽胞杆菌总活菌数测定013
四、基于宏基因组整合菌剂产品细菌微生物组测定016
五、整合微生物组菌剂对种子发芽的影响020
六、整合微生物组菌剂的壮苗作用021
七、整合微生物组菌剂对病害防控的作用022
第四节 整合微生物组菌剂特点及生产质量标准化讨论023
一、整合微生物组菌剂提出、研发与应用023
二、整合微生物组菌剂特点024
三、整合微生物组菌剂生产出大量的芽胞杆菌025
四、整合微生物组菌剂中猪病原菌的含量025
五、整合微生物组菌剂对种子发芽、种苗生长和病害防控的影响026
六、整合微生物组菌剂生产工艺和质量标准初步确定027
第二章 菌剂发酵床特征微生物空间分布028
第一节 菌剂发酵床芽胞杆菌生态位029
一、概述029
二、研究方法030
三、菌剂发酵床空间生态位垫料营养特性分析032
四、菌剂发酵床空间生态位细菌宏基因组测序033
五、菌剂发酵床空间生态位芽胞杆菌活菌计数034
六、基于宏基因组测序菌剂发酵床空间生态位芽胞杆菌数量（read）分布035
七、菌剂发酵床空间生态位芽胞杆菌亚群落分化039
八、菌剂发酵床空间生态位芽胞杆菌种群空间分布型041
九、菌剂发酵床空间生态位芽胞杆菌数量（read）与垫料营养特性的相关性042
十、菌剂发酵床芽胞杆菌空间生态位宽度044
十一、菌剂发酵床芽胞杆菌空间生态位重叠046
十二、讨论与总结048
第二节 菌剂发酵床芽胞杆菌数量与空间分布研究051
一、概述051
二、研究方法052
三、菌剂发酵床芽胞杆菌种类和数量分布055
四、菌剂发酵床芽胞杆菌空间分布056
五、菌剂发酵床芽胞杆菌空间分布型066
六、菌剂发酵床芽胞杆菌多样性指数068
七、讨论与总结071
第三节 菌剂发酵床真菌空间分布075
一、概述075
二、研究方法076
三、菌剂发酵床真菌的分离鉴定079
四、菌剂发酵床真菌种群空间分布格局080
五、菌剂发酵床真菌种群空间分布频次082
六、菌剂发酵床真菌种群空间分布型082
七、菌剂发酵床真菌种群多样性指数083
八、菌剂发酵床真菌种群生态位特性084
九、讨论与总结086
第三章 整合微生物组菌剂微生物组多样性088
第一节 整合微生物组菌剂微生物含量估计089
一、概述089
二、整合微生物组菌剂样本芽胞杆菌属活菌计数089
三、整合微生物组菌剂细菌含量的估算094
四、讨论与总结097
第二节 菌剂发酵床与堆肥工艺产品微生物组差异097
一、不同工艺细菌属种类差异097
二、不同工艺前5个优势细菌属结构差异110
三、不同工艺千级含量（read）细菌属组成差异111
四、不同工艺芽胞杆菌属种类差异112
五、菌剂发酵床与堆肥工艺产品细菌活菌数的估计113
六、讨论与总结114
第三节 整合微生物组菌剂细菌物种多样性114
一、整合微生物组菌剂细菌物种分析114
二、整合微生物组菌剂物种组成158
三、整合微生物组菌剂细菌样本特性247
四、整合微生物组菌剂细菌物种差异分析313
五、整合微生物组菌剂多级物种差异分析（LEfSe）338
六、整合微生物组菌剂细菌物种系统进化分析342
七、讨论与总结345
第四章 整合微生物组菌剂的作用机理347
第一节 概述348
一、土壤微生物组348
二、作物连作障碍及其防治349
三、微生物组的生产技术351
四、微生物组菌剂功能研究352
第二节 添加菌剂对肉汤实验可培养细菌群落影响353
一、概述353
二、研究方法353
三、可培养细菌分离355
四、可培养细菌鉴定360
五、不同菌剂对可培养细菌群落数量变化的影响369
六、整合菌剂对可培养细菌群落生态学特性的影响373
七、讨论与总结395
第三节 添加菌剂对肉汤实验微生物组的影响396
一、概述396
二、肉汤实验体系微生物组总量的恒定特性396
三、添加菌剂对肉汤实验微生物组结构变化的影响399
四、添加菌剂对肉汤实验细菌群落分布的影响406
五、讨论与总结415
第四节 添加菌剂对发酵阶段微生物组的影响415
一、肉汤实验发酵阶段的划分415
二、发酵阶段细菌群落组成的变化416
三、发酵阶段芽胞杆菌种群组成的变化449
四、讨论与总结457
第五节 添加菌剂对肉汤实验脂肪酸组的影响460
一、概述460
二、研究方法460
三、不同处理组肉汤实验过程脂肪酸组分析463
四、不同处理组肉汤实验过程特征脂肪酸变化499
五、不同处理组肉汤实验脂肪酸培养组变化520
六、讨论与总结550
第六节 添加菌剂对肉汤实验物质组的影响551
一、概述551
二、研究方法552
三、肉汤实验物质组发酵过程物质组变化552
四、添加芽胞菌剂发酵过程物质组特性分析561
五、添加链霉菌剂发酵过程物质组特性分析635
六、添加整合菌剂发酵过程物质组特性分析693
七、空白对照发酵过程物质组特性分析748
第五章 整合微生物组菌剂功能群与同工菌805
第一节 概述806
一、物种功能群806
二、微生物群落808
三、微生物功能群和同工菌811
第二节 研究方法814
一、肉汤实验814
二、微生物组和酶活性分析814
第三节 肉汤实验微生物组功能群的分析816
一、引言816
二、芽胞菌剂组功能群分析817
三、链霉菌剂组功能群分析820
四、整合菌剂组功能群分析824
五、空白对照组功能群分析827
六、讨论831
第四节 肉汤实验芽胞杆菌同工菌的分析831
一、引言831
二、芽胞菌剂组芽胞杆菌同工菌分析833
三、链霉菌剂组芽胞杆菌同工菌分析838
四、整合菌剂组芽胞杆菌同工菌分析842
五、空白对照组芽胞杆菌同工菌分析846
六、讨论850
第六章 整合微生物组菌剂的应用851
第一节 整合微生物组菌剂用于生防菌肥二次发酵852
一、用于细菌生防菌肥二次发酵852
二、用于真菌生防菌肥二次发酵858
第二节 整合微生物组菌剂用于植物疫苗二次发酵893
一、用于细菌植物疫苗二次发酵893
二、用于真菌植物疫苗二次发酵901
第三节 整合微生物组菌剂用于配制育苗基质908
一、概述908
二、研究方法908
三、不同配方的基质理化性质分析910
四、不同垫料浸提液对种子发芽的影响及不同基质对蔬菜生长的影响911
五、基于垫料的基质配方蔬菜育苗生长特性的相关性分析917
六、讨论919
第四节 整合微生物组菌剂用于防治番茄青枯病920
一、概述920
二、研究方法920
三、不同处理番茄根系的土壤养分含量分析922
四、青枯病植物疫苗对番茄育苗健康的作用923
五、青枯病植物疫苗及其应用方式对番茄田间生长特性的影响923
六、青枯病植物疫苗及其应用方式对番茄青枯病田间防效的影响924
七、讨论925
第五节 整合微生物组菌剂用于修复番茄连作障碍926
一、概述926
二、研究方法926
三、不同处理对土壤养分含量的影响928
四、不同处理对土壤酶活性的影响928
五、不同处理对番茄田间植株生长特性的影响929
六、不同处理对番茄青枯病害防效的影响929
七、讨论930
参考文献932