蛋白质晶体结构解析原理与技术--聚文网

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编辑推荐

本书主要对蛋白质结构的解析原理、流程与操作步骤进行了详细而系统的介绍，包括蛋白质纯化结晶、蛋白质晶体衍射数据收集、相关软件的安装和使用、蛋白质晶体结构文件提交到PDB数据库的步骤与使用可视化软件呈现蛋白质晶体结构的方法。文字简明易懂，配以大量图片方便读者理解。同时为了利于读者的实际操作，书中简化了深奥复杂的理论方程与公式，着重讲解蛋白质解析的实践流程，对于需要了解、学习蛋白质晶体解析的生物科技背景研究人员而言具有较高的参考价值。

内容简介

本书从实用的角度出发介绍了如何解析蛋白质晶体结构。全书分为6章，主要内容包括蛋白质结晶的方法、蛋白质晶体衍射数据收集、蛋白质晶体结构解析软件的安装和使用、蛋白质晶体结构文件提交到PDB的步骤及使用软件呈现蛋白质结构的方法。本书贴近实际操作，避开了各种深层次物理原理和数学知识，更多地讲解了软件操作流程与如何根据参数指标分析蛋白质晶体解析结果，易于具有生物科学背景的研究者理解；适用于蛋白质晶体结构研究领域的初学者和具备一定实验经验的研究者。

第一章蛋白质结晶前准备
第一节目的蛋白质信息检索与调查
第二节质粒制备
第三节蛋白质纯化
第四节蛋白质不表达和包涵体问题
第五节蛋白质活性鉴定
第六节蛋白质结晶前分析
第二章蛋白质结晶与衍射数据收集
第一节蛋白质结晶
第二节蛋白质晶体衍射数据收集
第三章蛋白质晶体结构解析软件安装
第一节Linux系统安装
第二节蛋白质晶体结构解析软件安装
第四章Index、integrate与scale
第一节一些晶体结构学知识
第二节蛋白质晶体结构解析流程
第三节Index和integrate
第四节Scale
第五节使用XSCALE功能进行scale
第六节使用HKL2000进行index、integrate和scale
第五章分子置换、构建优化与结构提交
第一节分子置换
第二节蛋白质晶体结构构建
第三节蛋白质晶体结构优化
第四节蛋白质晶体结构验证
第五节蛋白质晶体结构提交到PDB
第六章蛋白质晶体结构展示
第一节pdb格式文件简介
第二节PyMOL制作蛋白质晶体结构图
第三节使用PyMOL制作蛋白质配体结合位点的信息
第四节使用PyMOL调查蛋白质的温度因子B-factors
第五节使用PyMOL重叠对比不同的蛋白质晶体结构
第六节使用PyMOL显示蛋白质晶体结构中配体的电子密度图
第七节PyMOL结合Chimera实现同时显示非对称单元的蛋白质分子
参考文献

蛋白质晶体结构解析原理与技术

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