外来物种红耳龟入侵半咸水的生理生态机制

《外来物种红耳龟入侵半咸水的生理生态机制》从生理生态学角度系统阐述了红耳龟在半咸水环境中的野外生态适应性、渗透压调节、糖脂代谢调节、应激通路调节、肠道菌群调节等适应对策及相关机制，为红耳龟的生态危害评估及防控提供了理论依据和实践指导，为外来入侵物种适应机制的深入研究奠定了基础，为生态环境保护和生物多样性保护提供了技术支撑。

前言
第一章 外来物种红耳龟入侵概述 1
第一节 红耳龟形态、分类及地理分布 2
一、红耳龟的形态特征 2
二、红耳龟的分类地位 2
三、红耳龟的地理分布及入侵现状 2
第二节 红耳龟在中国的入侵现状 3
一、红耳龟在中国的分布 3
二、红耳龟的传入及扩散路径 4
第三节 红耳龟种群建立及传播机制 6
一、红耳龟的种群结构 6
二、红耳龟的生态适应性 7
三、红耳龟的天敌 13
第四节 红耳龟的入侵危害 13
一、对本土龟类的影响 13
二、对人类健康的影响 16
第五节 红耳龟的入侵管理 17
一、制定相关法律 18
二、规范养殖和市场 18
三、科学管理放生活动 18
四、加强宣传和教育 19
结语 19
参考文献 20
第二章 外来物种红耳龟对半咸水环境的生态适应 23
第一节 研究区域的自然概况 23
一、研究区域的位置与气候 23
二、植物资源 23
三、动物资源 24
第二节 半咸水环境中红耳龟的活动家域 24
一、半咸水环境中红耳龟的家域和核域 25
二、红耳龟在半咸水环境中的家域分析 26
第三节 半咸水环境中红耳龟对微生境的利用 26
一、微生境 27
二、半咸水环境中红耳龟微生境分析 29
第四节 红耳龟在半咸水环境中的食性 29
一、红耳龟取食的动物种类 30
二、红耳龟取食的植物种类 31
三、红耳龟年龄、性别与取食的关系 31
四、半咸水环境中红耳龟食性分析 32
第五节 红耳龟在半咸水环境中的繁殖 33
一、半咸水环境中红耳龟对巢址的选择 33
二、半咸水环境中红耳龟的筑巢行为 34
三、半咸水环境中红耳龟的窝卵数及孵化 35
四、半咸水环境中孵出的红耳龟稚龟 36
五、半咸水环境中红耳龟繁殖状况分析 36
结语 37
参考文献 38
第三章 红耳龟对盐度的耐受性及消化生理调节 42
第一节 红耳龟对环境盐度的耐受性 42
一、环境盐度的设置范围 42
二、红耳龟的存活情况 43
三、红耳龟的临床特征及病理剖检 43
第二节 半咸水环境中对红耳龟的消化生理调节 43
一、半咸水环境中红耳龟消化酶活力 43
二、半咸水环境中红耳龟肝脏组织结构变化 45
三、半咸水环境中红耳龟肠道组织结构变化 45
四、半咸水环境中红耳龟消化生理分析 45
结语 46
参考文献 46
第四章 红耳龟适应半咸水环境的渗透压调节 48
第一节 半咸水环境中红耳龟渗透压的调节 48
一、半咸水环境中红耳龟血浆渗透压 49
二、半咸水环境中红耳龟血浆离子浓度 50
三、半咸水环境中红耳龟尿液离子浓度 51
四、半咸水环境中红耳龟血清醛固酮含量 52
五、半咸水环境中红耳龟Na+-K+-ATP酶活力 52
六、半咸水环境中红耳龟血液和尿液中含氮代谢物含量 53
七、半咸水环境中红耳龟对渗透压的调节分析 55
第二节 半咸水环境中游离氨基酸对渗透压的调节 56
一、半咸水环境中红耳龟肌肉游离天冬酰胺含量 57
二、半咸水环境中红耳龟肌肉游离组氨酸含量 57
三、半咸水环境中红耳龟肌肉游离丙氨酸含量 57
四、半咸水环境中红耳龟肌肉游离谷氨酸和谷氨酰胺含量 58
五、半咸水环境中红耳龟肌肉总游离氨基酸含量 58
六、半咸水环境中游离氨基酸对渗透压的调节作用分析 61
第三节 半咸水环境中红耳龟肝脏转录组学分析 62
一、红耳龟序列数据质量分析 62
二、红耳龟基因功能注释 64
三、根据转录组数据分析红耳龟适应半咸水环境的渗透压调节机制 72
结语 74
参考文献 75
第五章 红耳龟适应半咸水环境的糖脂代谢调节 79
第一节 半咸水环境中红耳龟对营养物质的利用 79
一、半咸水环境中红耳龟血糖和肝糖原的含量 79
二、半咸水环境中红耳龟血清和肝脏可溶性蛋白的含量 80
三、半咸水环境中红耳龟血清脂质成分的含量 82
四、半咸水环境中红耳龟对营养物质利用的分析 83
第二节 红耳龟AMPK亚基分布及在半咸水环境中的表达 83
一、AMPK在红耳龟各组织中的表达分布 84
二、半咸水环境中红耳龟AMPK的表达及活力 86
三、半咸水环境中红耳龟AMPK变化分析 86
第三节 半咸水环境中红耳龟脂肪代谢相关通路的调控 87
一、半咸水环境中红耳龟脂肪代谢转录因子的表达 87
二、半咸水环境中红耳龟脂肪合成代谢相关基因的表达 89
三、半咸水环境中红耳龟脂肪分解代谢相关基因的表达 90
四、半咸水环境中红耳龟脂肪代谢相关酶的活力 92
五、半咸水环境中红耳龟脂肪代谢通路分析 93
第四节 半咸水环境中红耳龟糖代谢相关通路的调控 94
一、半咸水环境中红耳龟糖代谢相关酶活力及GLUT4含量 95
二、半咸水环境中红耳龟糖代谢主要调控基因的表达 96
三、半咸水环境中红耳龟糖代谢通路分析 97
结语 98
参考文献 99
第六章 红耳龟适应半咸水环境的抗氧化防御调节 104
第一节 半咸水环境中红耳龟的抗氧化酶系统 104
一、超氧化物歧化酶mRNA表达及酶活力 105
二、过氧化氢酶mRNA表达及酶活力 106
三、谷胱甘肽过氧化物酶mRNA表达及酶活力 107
四、谷胱甘肽转硫酶的mRNA表达 109
五、半咸水环境中红耳龟抗氧化酶系统分析 110
第二节 半咸水环境中红耳龟抗氧化系统调控通路 111
一、半咸水环境中红耳龟Nrf2/Keap1信号通路的活化 111
二、半咸水环境中红耳龟TOR及S6K1信号的激活 112
三、半咸水环境中红耳龟抗氧化系统调控通路分析 114
第三节 半咸水环境中红耳龟氧化应激效应物的变化 115
一、半咸水环境中红耳龟丙二醛的含量 115
二、半咸水环境中红耳龟丙二醛变化分析 115
结语 116
参考文献 117
第七章 红耳龟适应半咸水环境的免疫调节 121
第一节 半咸水环境中红耳龟免疫细胞因子调节 121
一、血清中主要免疫细胞因子的含量 122
二、红耳龟肝脏和心脏主要免疫细胞因子mRNA表达 125
三、半咸水环境中红耳龟免疫细胞因子分析 128
第二节 半咸水环境中红耳龟NF-κB通路的调控 129
一、半咸水环境中红耳龟NF-κB的表达 129
二、半咸水环境中红耳龟IκB的表达 130
三、红耳龟适应半咸水环境的NF-κB通路分析 132
结语 133
参考文献 133
第八章 红耳龟适应半咸水环境的JAK-STAT通路应答 138
第一节 半咸水环境中红耳龟JAK-STAT的表达 138
一、半咸水环境中红耳龟JAK家族反应 138
二、半咸水环境中红耳龟STAT3应答 140
三、半咸水环境中红耳龟JAK-STAT通路分析 140
第二节 半咸水环境中红耳龟JAK-STAT通路的负调控 142
一、细胞因子信号转导抑制蛋白（SOCS）的表达 142
二、活化STAT蛋白抑制因子（PIAS）的表达 143
三、半咸水环境中红耳龟JAK-STAT通路的负调控因子分析 145
第三节 半咸水环境中JAK-STAT通路对其靶基因的调控 146
一、半咸水环境中红耳龟Mcl-1的表达 146
二、半咸水环境中红耳龟Bcl-xL的表达 147
三、半咸水环境中红耳龟JAK-STAT通路靶基因分析 147
结语 148
参考文献 149
第九章 红耳龟适应半咸水环境的p53信号通路调控 153
第一节 红耳龟p53基因序列分析 153
一、红耳龟p53基因序列及其编码的氨基酸序列 154
二、红耳龟p53基因与其他物种的进化关系 154
第二节 半咸水环境中红耳龟p53基因的表达分布 157
一、红耳龟p53基因在各组织中的分布 157
二、半咸水环境中p53基因的表达变化 158
三、半咸水环境中红耳龟p53基因表达分析 159
第三节 半咸水环境中p53对细胞周期的调控 159
一、半咸水环境中红耳龟CDK的表达 160
二、半咸水环境中红耳龟细胞周期蛋白的表达 161
三、半咸水环境中红耳龟p21的表达 162
四、半咸水环境中红耳龟细胞周期调控分析 163
第四节 半咸水环境中p53对红耳龟细胞凋亡的调控 164
一、半咸水环境中红耳龟Bcl-2家族调控 164
二、半咸水环境中红耳龟caspase 3的表达 166
三、半咸水环境中红耳龟细胞凋亡发生情况 166
四、半咸水环境中红耳龟细胞凋亡的分析 167
结语 168
参考文献 168
第十章 红耳龟适应半咸水环境的肠道菌群调节 173
第一节 半咸水环境中红耳龟肠道菌群多样性分析 174
一、OTU分析 174
二、稀释曲线分析 174
三、Alpha多样性指数 174
第二节 半咸水环境中红耳龟肠道菌群物种组成 175
一、基于门分类水平的物种注释 175
二、基于属分类水平的物种注释 176
三、红耳龟肠道菌群的特有OTU 177
四、红耳龟肠道菌群的物种差异分析 178
第三节 半咸水环境中红耳龟肠道菌群系统发育及功能预测 180
一、系统发生进化树 180
二、红耳龟肠道菌群16S功能预测 181
三、半咸水环境中红耳龟肠道菌群功能分析 184
结语 185
参考文献 185