瘤牛抗病力分子机制研究

抗病育种是增强家养动物天然免疫力和抗病力的重要途径。《瘤牛抗病力分子机制研究》围绕分子遗传学的中心法则，从候选基因、DNA甲基化、microRNA、蛋白质组学4个层面来解析瘤牛抗病力的分子机制，为培育抗病力强的家牛新品种提供科学依据和关键技术支撑。

第1章 家牛品种资源概况
1.1 普通牛和瘤牛的外形差异
1.2 普通牛和瘤牛的抗病力差异
参考文献
第2章 候选基因、DNA甲基化、microRNA与蛋白质组学简况
2.1 候选基因
2.1.1 Toll样受体家族
2.1.2 RLR家族
2.2 DNA甲基化
2.2.1 DNA甲基化的定义与特征
2.2.2 DNA甲基化在哺乳动物中的应用
2.3 microRNA
2.3.1 microRNA的定义
2.3.2 microRNA的作用
2.3.3 microRNA在家牛中的应用
2.4 蛋白质组学
2.4.1 蛋白质组学在家牛疫病方面的研究进展
2.4.2 蛋白质组学在家畜研究中的应用
参考文献
第3章 候选基因序列变异与普通牛和瘤牛间抗病力差异分析
3.1 Toll样受体基因序列变异与云南普通牛和瘤牛间抗病力差异分析
3.1.1 材料与方法
3.1.2 结果与分析
3.1.3 讨论.
3.2 RIG-Ⅰ样受体基因序列变异与云南普通牛和瘤牛间抗病力差异分析
3.2.1 材料与方法
3.2.2 结果与分析
3.2.3 讨论
参考文献
第4章 基于全基因组重亚硫酸盐测序的普通牛与瘤牛的DNA甲基化差异分析
4.1 材料与方法
4.1.1 实验材料
4.1.2 实验方法
4.1.3 数据分析
4.2 结果与分析
4.2.1 WGBS数据质量控制和序列比对
4.2.2 数据统计和覆盖度分析
4.2.3 甲基化C分布趋势分析
4.2.4 碱基偏好性
4.2.5 甲基化图谱
4.2.6 差异甲基化分析
4.2.7 GO功能分析
4.2.8 KEGG通路分析
4.3 讨论
参考文献
第5章 普通牛和瘤牛肝、脾组织中microRNA的鉴定及差异表达分析
5.1 材料与方法
5.1.1 实验材料
5.1.2 实验方法
5.1.3 数据分析
5.2 结果与分析
5.2.1 高通量测序数据结果
5.2.2 已知miRNA和新miRNA的鉴定及分析
5.2.3 各样本miRNA的表达分析
5.2.4 已知miRNA和新miRNA的差异表达分析
5.2.5 差异表达已知miRNA的靶基因预测
5.2.6 差异表达已知miRNA靶基因的功能富集分析
5.2.7 RT-qPCR验证miRNA的表达分析
5.3 讨论
参考文献
第6章 普通牛和瘤牛肝、脾组织的比较蛋白质组学研究
6.1 材料与方法
6.1.1 实验材料
6.1.2 实验方法
6.1.3 数据分析
6.2 结果与分析
6.2.1 肝、脾组织蛋白质的质谱结果
6.2.2 差异蛋白分析
6.2.3 蛋白质GO功能注释分析
6.2.4 蛋白质KEGG通路分析
6.2.5 参与原虫疾病通路的差异蛋白分析
6.2.6 PRM验证差异蛋白的结果分析
6.3 讨论
参考文献
附录