表观遗传学(全2册)

本书分为三部分，基础部分涵盖表观遗传学的基本概念，重要理论及表观遗传学现象的解释。应用部分从生殖发育开始，涵盖了干细胞编程与重编程，造血及免疫系统的发育与自身免疫疾病，肿瘤的发生发展以及药物研发等内容。方法学涵盖了表观遗传学最常用DNA甲基化，染色质免疫共沉淀等以及生物信息学分析。

第1章 表观遗传学概论 1
参考文献 3
第2章 DNA甲基化 5
2.1 DNA甲基化概述 5
2.2 DNA甲基化与细胞记忆机制 7
2.3 DNA甲基化模式的建立和维持 8
2.4 DNA甲基化在基因表达调控中的作用 12
2.5 DNA甲基化在哺乳动物中的主要功能 16
2.6 DNA甲基化与疾病 19
2.7 DNA甲基化相关问题与展望 23
参考文献 24
第3章 DNA去甲基化 28
3.1 DNA去甲基化概述 28
3.2 TET概述 35
3.3 DNA去甲基化相关问题与展望 42
3.4 DNA去甲基化研究面临的挑战 44
参考文献 45
第4章 基因组印记 51
4.1基因组印记概述 51
4.2 小鼠的印记基因 56
4.3 基因组印记的调控 58
4.4 印记基因群区的典型调控模型 65
4.5 基因组印记的正常功能 67
4.6 印记基因失常与人类疾病 69
4.7 基因组印记的起源与进化 70
4.8 总结与展望 71
参考文献 72
第5章 基因剂量补偿和X染色体失活 76
5.1 性别决定与基因剂量补偿的概述 76
5.2 哺乳类X染色体失活的发现与简介 80
5.3 X染色体失活的动物模型与分子机制 84
5.4 X染色体失活与人类疾病 89
5.5 总结与展望 92
参考文献 93
第6章 组蛋白甲基化修饰 100
6.1 蛋白质甲基化研究小史 100
6.2 组蛋白甲基化酶的种类及催化的修饰类型 101
参考文献 111
第7章 组蛋白去甲基化 117
7.1 组蛋白去甲基化动态调控的研究历史概述 117
7.2 组蛋白去甲基化酶的命名 121
7.3 组蛋白去甲基化酶的生物学功能 123
7.4 组蛋白去甲基化酶在制药领域的潜在应用 127
参考文献 129
第8章 组蛋白乙酰化 131
8.1 组蛋白乙酰化的发现 131
8.2 组蛋白乙酰化酶及其复合物 133
8.3 组蛋白去乙酰化酶和抑制剂 138
8.4 乙酰化识别蛋白 143
8.5 组蛋白乙酰化的作用机制及功能 145
8.6 组蛋白乙酰化与人体生理病理 150
8.7 组蛋白乙酰化修饰与药物研发 152
8.8 展望 153
参考文献 154
第9章 组蛋白其他修饰与组蛋白变体 162
9.1 组蛋白其他修饰与组蛋白变体概述 162
9.2 组蛋白磷酸化修饰 167
9.3 组蛋白新型酰化修饰 170
9.4 基于质谱检测的组蛋白修饰鉴定与定量分析 181
9.5 组蛋白变体 187
参考文献 193
第10章 组蛋白修饰识别 206
10.1 组蛋白修饰识别概述 206
10.2 组蛋白修饰识别的分子基础 207
10.3 组蛋白修饰识别的调控机制 210
10.4 组蛋白修饰识别的生物学功能 212
10.5 组蛋白修饰识别与染色质信号转导 215
10.6 组蛋白修饰识别因子的鉴定方法与技术 218
10.7 组蛋白阅读器靶向的药物研发 220
参考文献 222
第11章 染色质重塑 228
11.1 染色质重塑概述 228
11.2 核小体定位与基因调控 229
11.3 组蛋白分子伴侣 233
11.4 染色质重塑复合体 238
11.5 染色质重塑与疾病 243
参考文献 244
第12章 染色质结构与组蛋白变体 247
12.1 染色体结构 247
12.2 组蛋白变体 254
参考文献 261
第13章 CTCF与三维基因组染色质高级结构 265
13.1 CTCF与DNA的相互作用 265
13.2 CTCF与黏连蛋白协同架构三维基因组染色质高级结构 270
13.3 CTCF与染色质高级结构 272
13.4 CTCF与基因表达调控 275
13.5 总结与展望 283
参考文献 285
第14章 Polycomb复合物及Trithorax复合物 289
14.1 Polycomb复合物和Trithorax复合物概论 290
14.2 Polycomb复合物 293
14.3 Trithorax复合物 302
14.4 Polycomb复合物和Trithorax复合物相关抑制剂 308
14.5 总结与展望 309
参考文献 310
第15章 DNA甲基化修饰酶的结构生物学研究 315
15.1 DNA甲基转移酶 315
15.2 DNA去甲基化调控酶 323
参考文献 326
第16章 非编码RNA 330
16.1 非编码RNA概述 330
16.2 非编码RNA种类 332
16.3 非编码RNA特征、产生及生物学功能 332
16.4 非编码RNA与疾病 340
16.5 研究非编码RNA的方法学 342
16.6 总结与展望 344
参考文献 345
第17章 siRNA 348
17.1 RNAi概述 348
17.2 siRNA的加工生成 349
17.3 RNAi的调控机制 353
17.4 RNAi引起的毒副作用 358
17.5 RNAi药物的前景与挑战 360
参考文献 362
第18章 RNAa 365
18.1 RNAa概述 365
18.2 外源性RNAa 368
18.3 内源性RNAa 372
18.4 线虫中的RNAa 374
18.5 RNAa的应用 375
18.6 RNAa领域面临的问题与展望 376
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