生物信息处理技术与方法

罗森林、潘丽敏、马俊编著的《生物信息处理技 术与方法》共分8章，主要内容包括生物信息处理知 识基础、数据处理方法基础、序列比对方法、系统发 生树构建方法、基因芯片数据处理方法、RNA结构预 测方法、蛋白质结构预测方法、生物分子网络构建方 法等。 本书可用作计算机科学与技术、生命信息工程、 软件工程、通信与信息系统等相关学科、专业的教材 ，也可作为参考书直接使用，同时也可供科研人员参 考和有兴趣者自学使用。

罗森林，男，汉族，1968年2月出生，博士(后)，教授，博导。1998年获得北京理工大学电子工程系通信与电子系统博士学位；2000年10月于中国科学院计算技术研究所计算机科学博士后流动站出站后，到北京理工大学工作至今。现为北京理工大学信息系统及安全对抗实验中心主任，学科、专业责任教授， 特色专业、北京市特色专业、国防特色专业、工业和信息化部重点专业建设负责人。 科研方向为网络安全、数据挖掘、文本安全和媒体安全，承担省部级以上科研项目三十余项。出版著作和教材9部，其中国家级规划教材3部，北京市精品教材4部。获国家级和省部级科研、教学成果奖及质量工程项目二十余项。

第1章 绪论 1.1 产生背景和意义 1.2 知识基础 1.3 发展简史和现状 1.4 数据库及技术工具 1.5 技术难点与发展趋势 1.6 本章小结 思考题 第2章 数据处理方法基础 2.1 引言 2.2 概率论基础 2.3 数据预处理 2.4 数据分类分析 2.5 数据聚类分析 2.6 关联规则发现 2.7 隐马尔科夫模型 2.8 数据处理效果评价 2.9 高维数据处理 2.10 本章小结 思考题 第3章 序列比对方法 3.1 引言 3.2 序列比对知识基础 3.3 主要技术方法及分析 3.4 双序列比对 3.5 多序列比对 3.6 应用实例分析 3.7 本章小结 思考题 第4章 系统发生树构建方法 4.1 引言 4.2 系统发生树知识基础 4.3 主要技术方法及分析 4.4 基于距离的构建方法 4.5 基于离散特征的构建方法 4.6 Quartet方法 4.7 应用实例分析 4.8 本章小结 思考题 第5章 基因芯片数据处理方法 5.1 引言 5.2 基因芯片知识基础 5.3 主要技术方法及分析 5.4 基因芯片数据预处理 5.5 基因芯片数据聚类分析 5.6 基因芯片数据分类分析 5.7 应用实例分析 5.8 本章小结 思考题 第6章 RNA结构预测方法 6.1 引言 6.2 RNA知识基础 6.3 主要技术方法及分析 6.4 比较序列分析方法 6.5 动态规划算法 6.6 组合优化算法 6.7 启发式算法 6.8 应用实例分析 6.9 本章小结 思考题 第7章 蛋白质结构预测方法 7.1 引言 7.2 蛋白质结构知识基础 7.3 主要技术方法及分析 7.4 蛋白质二级结构预测 7.5 蛋白质三级结构预测 7.6 应用实例分析 7.7 本章小结 思考题 第8章 生物分子网络构建方法 8.1 引言 8.2 生物分子网络知识基础 8.3 主要技术方法及分析 8.4 基因调控网络构建方法 8.5 蛋白质互作网络构建方法 8.6 应用实例分析 8.7 本章小结 思考题 参考文献