基因调控系统的动力学分析--聚文网

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内容简介

基因调控系统描述了生物过程的基因表达以及调控，对其动力学的分析有助于理解相应生物过程的机理。本书考虑了与肿瘤抑制蛋白 p53有关的基因调控系统，由于p53的动力学对受到压力后的细胞命运起到重要作用，所以我们通过非线性动力学的理论和方法，分析了系统中重要的蛋白质表达水平以及反应速率常数对p53 动力学的影响，并通过能量面、概率流和熵产生率分析了p53动力学的稳定性。此外，本书探讨了噪声对一个耦合正反馈回路中双稳态动力学的影响，并用能量面解释了稳态切换的原理。

第一章绪论一、研究背景与意义二、研究现状三、本书的研究工作第二章基础知识一、基因调控系统中的分子生物学概念（一）基因表达中的基本成分（二）基因表达（三）基因调控系统的研究内容二、基因调控系统的确定性模型及研究理论（一）常微分方程及希尔函数（二）稳定性分析和分岔理论三、基因调控系统的随机动力学理论和方法（一）化学主方程和Gillespie算法（二）化学朗之万方程（三）福克尔一普朗克方程四、非平衡系统（一）非平衡系统的基本概念（二）能量面和概率流本章小结第三章 p53-Mdm2振子的动力学和稳定性一、生物背景二、p53-Mdm2模型和能量面方法（一）p53-Mdm2模型（二）能量面方法三、研究结果（一）Mdm2生成速率调控的p53-Mdm2振子的动力学和稳定性（二）Mdm2降解速率调控的p53-Mdm2振子的动力学和稳定性本章小结第四章 PDCD5调控的p53-Mdm2模块的分岔分析和能量面一、生物背景二、模型方程三、研究结果 (一)无量纲化 (二)p53振荡的周期和振幅对参数变化的敏感性分析 (三)余维-2分岔分析 (四)余维-1分岔分析 (五)能量面和全局动力学 (六)PDCD5调控效率对系统的影响本章小结第五章基于能量面的噪声引起的双稳态切换的动力学一、生物背景二、模型引入三、研究结果 (一)余维-2和余维-1分岔确定的双稳态区域 (二)反馈强度引起的双稳态切换动力学 (三)基于能量面的两个稳态的稳定性分析本章小结第六章结论和展望一、本书总结二、研究展望参考文献后记

基因调控系统的动力学分析

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