缺氧诱导小分子RNA调控肾癌侵袭转移的分析与研究(精)/同济博士论丛

本书借助高通量基因表 达数据库，使用生物信息学 方法，分析肾细胞癌的高通 量测序大数据，进而通过 miRNA芯片技术，分析临床 ccRcc患者肿瘤与癌旁组织 中的miRNAs，两者交叉验 证，筛选出参与肾癌发病过 程的miRNAs，探究其作用 机制，最终为检测和治疗肾 癌提供新的理论依据，从而 促进肾癌的机制研究、临床 诊断和治疗。本书适合高校 医学专业师生及相关研究人 员阅读。

总序 论丛前言 前言 第1章 GEO中肾透明细胞癌高通量测序数据库的生物信息学分析 1.1 概述 1.2 疾病相关的基因芯片数据库发掘临床肿瘤新标靶 第2章 人肾透明细胞癌中的miRNA表达谱芯片检测及靶基因分析 2.1 材料与方法 2.1.1 实验设备及主要仪器 2.1.2 主要实验试剂及试剂盒 2.1.3 miRNA芯片实验方法 2.2 miRNA芯片数据的分析方法 2.2.1 差异miRNA的筛选 2.2.2 基因功能的显著性分析(G0-Analysis) 2.2.3 基因通路的显著性分析(Pathway-Analysis) 2.3 结果 2.3.1 肾癌标本临床及病理资料 2.3.2 miRNA芯片实验结果和热图分析 2.3.3 肾癌标本中差异miRNAs的靶基因分析 2.3.4 肾癌标本中差异靶基因的显著性功能分析(GO Analysis) 2.3.5 肾癌标本中差异基因的显著性pathway分析和其调控网路分析 2.4 讨论 2.5 结论 第3章 肾透明细胞癌组织中miR-646、相关基因检测及其与肿瘤患者临床相关因素分析 3.1 材料 3.1.1 临床样本 3.1.2 实验用试剂 3.1.3 实验用仪器 3.2 方法 3.2.1 miRNA荧光定量PCR操作流程 3.2.2 靶基因NOBl和SLC4Al检测 3.2.3 靶基因NOBl和SLC4A1的蛋白表达水平检测(Western blot) 3.2.4 免疫组织化学检测NOBl蛋白表达 3.2.5 统计分析方法 3.3 结果 3.3.1 肾透明细胞癌中miR-646和NOBl的表达情况和单变量和多变量风险模型分析 3.3.2 不同级别肾透明细胞癌中NOBl的表达情况及其与临床病理特征的关系 3.4 讨论 3.5 结论 第4章 miR-646靶基因验证及其在肾透明细胞癌中的作用及机制研究 4.1 材料和仪器 4.1.1 细胞系及动物模型 4.1.2 细胞培养基质粒抽提相关试剂盒 4.1.3 实验主要仪器 4.2 方法 4.2.1 靶基因双荧光素酶活性检测 4.2.2 转染后肾癌细胞系和293T细胞中miR-646和相关因的表达水平检测 4.2.3 转染miR-646后肾透明细胞癌细胞增殖影响的检测(MTT法) 4.2.4 转染miR-646后肾透明细胞癌细胞迁移的检测(Wound healing法) 4.2.5 转染miR-646后肾透明细胞癌细胞凋亡的检测(FACS)