传染性疾病与精准预防(精)/精准预防诊断系列

本书为“精准医学出版工程·精准预防诊断系列”图 书之一。人类对传染病的认识和对传染病的防控能力经历 了从模糊到清晰的过程。随着基因组学等多种组学、信息 化、大数据、学习和分析方法的高度发展，人类对传染病 诊断、预防、控制方面的认知更为深刻，技术更为精准。 传染病的精准预防，实际上是通过利用组学、大数据和分 析创新技术，取得更深刻和精准的传染病防控能力。本书 介绍精准医学理念在传染病预防方面的发展和应用，重点 在传染病的分子诊断、病原体基因组学的传染病防控应 用、流行病学大数据挖掘利用、精准疫苗预防等方面，介 绍基因组学、流行病学大数据的处理方法和应用，将患 者、健康人、疾病、病原体、暴发、传播事件均作为个 体，利用大数据深刻认识、区分个体和服务于个性化处 置，实现对传染病控制和预防的精准化。本书适合从事预 防医学、临床医学的科研与临床人员阅读，也适合高等医 学公共卫生、临床医学和广大社区医学工作者阅读。

1 传染病防控与精准医学 1.1 人类对传染病及其感染病原体的认识从模糊到 精确 1.2 感染中的病原体确认 1.2.1 判断感染病因 1.2.2 条件致病微生物带来的困惑 1.2.3 在微生物组的环境下判断病原体 1.2.4 病原体的诊断标志筛选 1.2.5 对病原体的认知进入基因组时代 1.3 传染病暴发疫情需要精准的识别和控制 1.3.1 病原体分子分型和基因组分析——精准判别 同种病原体中的不同株 1.3.2 自不同病例发现相同分子分型特征的病原 体——提示可能存在暴发 1.3.3 精准的病例定义一一增加病例-对照调查中 危险因素识别的精准性 1.4 流行病学大数据分析发现传播规律 1.4.1 传染病信息进入大数据时代 1.4.2 传染病发生和传播数据的收集和分析 1.5 疫苗接种群体免疫中的个体化 1.6 小结 参考文献 2 传染病的分子诊断—提高诊断的精准性 2.1 多重病原体高通量核酸检测技术 2.1.1 多重PCR技术 2.1.2 再测序芯片技术 2.2 下一代测序技术 2.2.1 短读长的下一代测序 2.2.2 长读长的下一代测序 2.2.3 下一代测序技术的应用 2.3 小结 参考文献 3 病原体基因组学——对病原体的深入认识 3.1 病原微生物基因组学 3.1.1 细菌基因组学的发展历史 3.1.2 细菌基因组学技术 3.1.3 细菌基因组学数据库 3.2 微生物基因组的分类学 3.2.1 分类学发展史 3.2.2 常用基因组分类学方法 3.3 分子血清学分型 3.3.1 传统的细菌血清学分型 3.3.2 分子生物学技术 3.3.3 细菌表面多糖抗原的高度多样性 3.3.4 基因水平的遗传学多样性 3.3.5 分子血清学分型技术体系的建立 3.3.6 分子血清学分型技术的发展前景 3.4 基于基因组分析耐药 3.4.1 细菌耐药组的定义 3.4.2 细菌耐药组的分类