蛋白质晶体结构解析原理与技术--聚文网

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内容简介

本书从实用的角度出发介绍了如何解析蛋白质晶体结构。全书分为6章，主要内容包括蛋白质结晶的方法、蛋白质晶体衍射数据收集、蛋白质晶体结构解析软件的安装和使用、蛋白质晶体结构文件提交到PDB的步骤及使用软件呈现蛋白质结构的方法。本书贴近实际操作，避开了各种深层次物理原理和数学知识，更多地讲解了软件操作流程与如何根据参数指标分析蛋白质晶体解析结果，易于具有生物科学背景的研究者理解；适用于蛋白质晶体结构研究领域的初学者和具备一定实验经验的研究者。

作者简介

苏纪勇，东北师范大学生命科学学院副教授。德国图宾根大学生物学专业博士，德国马克斯普朗克遗传与发育研究所博士后。主要研究与糖类相互作用的蛋白质，包括半乳糖凝集素家族、C型凝集素、糖苷水解酶和糖苷转移酶等。

第一章蛋白质结晶前准备第一节目的蛋白质信息检索与调查第二节质粒制备第三节蛋白质纯化第四节蛋白质不表达和包涵体问题第五节蛋白质活性鉴定第六节蛋白质结晶前分析第二章蛋白质结晶与衍射数据收集第一节蛋白质结晶第二节蛋白质晶体衍射数据收集第三章蛋白质晶体结构解析软件安装第一节 Linux系统安装第二节蛋白质晶体结构解析软件安装第四章 Index、integrate与scale 第一节一些晶体结构学知识第二节蛋白质晶体结构解析流程第三节 Index和integrate 第四节 Scale 第五节使用XSCALE功能进行scale 第六节使用HKL2000进行index、integrate和scale 第五章分子置换、构建优化与结构提交第一节分子置换第二节蛋白质晶体结构构建第三节蛋白质晶体结构优化第四节蛋白质晶体结构验证第五节蛋白质晶体结构提交到PDB 第六章蛋白质晶体结构展示第一节 pdb格式文件简介第二节 PyMOL制作蛋白质晶体结构图第三节使用PyMOL制作蛋白质配体结合位点的信息第四节使用PyMOL调查蛋白质的温度因子B-factors 第五节使用PyMOL重叠对比不同的蛋白质晶体结构第六节使用PyMOL显示蛋白质晶体结构中配体的电子密度图第七节 PyMOL结合Chimera实现同时显示非对称单元的蛋白质分子参考文献

蛋白质晶体结构解析原理与技术

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